トマトの花は、蕾ができる時に栄養を吸収しすぎると肥満の蕾になり、少ないとやせ形の蕾になります。

　お尋ねの茶色くなった状態は、肥満の蕾の開花後、果実が肥大するにつれてできあがったものと思われます。茶色の部分は花びらがついていた跡で、果実が大きく肥大するほど数㎜ から１㎝ くらいの幅にもなります。

　このような果実は正常な果実より大きくなり、横に広く変型するのが一般的です。これは鬼実ともいわれ、花の段階では鬼花と呼ばれます。鬼花の発現は３～５段（房）目に多く、初期生育が強い株ほど多くなります。

　原因としては３～５段の蕾が発達する時期に効く肥料、すなわち、元肥と第１回目の追肥（特にチッソ分）が多すぎることが挙げられます。